自学考试论文申请程序：1.在规定时间内申请；2.论文交费和选定指导老师；3.论文知识相关讲座；4.开始撰写毕业论文；5.论文答辩。
一、自学考试论文申请时间
凡是按专业考试计划取得本科规定的全部课程成绩合格的考试，可以在上半年6月、下半年12月左右(具体日期参考当教育考试院)，到当地自学考试办进行资格审定。
自学考试论文申请时，需要携带自学考试考生本人身份证、准考证、专科毕业证书原件、各科考试成绩单以及免考证明。
二、自学考试论文申请缴费
自学考试毕业论文申请的缴费需要先和选定的指导教师沟通，考生在通过资格审定后要在规定时间(通常一周左右)到主考院校办理交费手续。主考院校收取费用之后，根据自学考试考生选择的专业及个人情况，为自学考试考生选择指导教师，同时将指导教师的联系方式告知自学考试考生。同时发给考生撰写毕业论文的具体材料(包括撰写方式、论文要求、交稿时间、报到答辩时间、论文参选题目等)。
三、自学考试论文知识讲座
自学考试论文知识讲座主要是给自学考试考生们讲解什么是自学考试论文?怎样选择自学考试论文的题目?怎样为自学考试论文收集素材以及结构文章等。自学考试论文讲座主要是帮助自学考试考生们更加清晰的进行自学考试毕业论文的写作，更好完成自学考试论文。
四、自学考试毕业论文撰写
自学考试论文撰写主要是确立题目、确定自学考试论文立意等。
自学考试毕业论文格式为：
(1)论文标题
(2)作者姓名
(3)内容摘要(中英文各一次)
(4)关键词
(5)自学考试论文正文(绪论、本论、结论)
(6)参考文献(大致为你的自学考试毕业论文主要借鉴了哪些文章)
五、自学考试毕业论文答辩
自学考试毕业论文答辩时间大概在每年的6月和12月左右，具体时间需要自学考试考生去当地自学考试考办查询。自学考试毕业论文完成后，由自学考试主考院校统一安排相关专业教师，组成自学考试毕业论文答辩组。首先考生简单进行自己的自学考试论文的陈述，然后由自学考试答辩小组进行提问，考生作答。
最后由自学考试答辩小组商议，给予自学考试考生论文分数，成绩分为优、良、及格、不及格四个等级。
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