在节能温室中栽培黄瓜已经发现的病害有数十种，经常发生、为害比较严重的有10余种。在这些病害中，除黄瓜霜霉病等极少数病害是借助气流和人们的农事活动从温室外面传入外，绝大多数真菌性、细菌性病害和部分病毒性病害。例如发生最为普遍、为害最为严重的灰霉病、疫病、枯萎病、蔓枯病、苗期猝倒病、立枯病等真菌性病害和多种细菌性、病毒性病害，其病菌都是在土壤中或借助病残体在土壤中越冬。这些病害的初次侵染，几乎都是来自温室内的土壤。所以说，是否能够预防和控制住土传病害发生，是节能温室黄瓜栽培成败的关键。
防治土传病害，必须认真贯彻“预防为主，综合防治”的植保方针，切实做好以下工作。
（1）利用温室封闭性能好的特点，在暑季室内作物换茬时，采取水淹、火烧、高温闷室等技术措施，铲除室内土壤中残留病菌，净化土壤，力争室内无菌，杜绝以上各类病害的初次侵染。
（2）注意肥料卫生，严防带菌肥料进入温室。施用的有机肥料，必须经过暑季覆盖塑料薄膜高温处理、充分腐熟，并用3000倍液的96%天达恶霉灵药液细致喷洒杀菌后，方可施用。
（3）管理人员入室，要在室外的操作房中更换鞋袜和工作服，防止衣物、鞋袜带菌入室；操作房地面，要撒石灰面消毒，鞋袜和工作服，要勤洗、勤晒、杀菌消毒；人员入温室后，要随手关门落锁，严禁外来人员，特别是其他温室的管理人员进入室内，以防其他温室病害交互感染和室外病菌侵入温室内。
（4）培育壮苗。育苗时，要选用无菌基质配制营养土，并用3000倍液的96%天达恶霉灵药液，细致喷洒营养土，彻底杀灭基质内残存病菌。
此外，为数不少的病害，由种子带菌，育苗前须用3000倍液的96%天达恶霉灵或0.5%～1%的高锰酸钾、10%磷酸三钠等药液浸种10～30分钟，杀灭病菌。
建苗床时，要在苗床底部铺农膜，农膜上铺石子或沙粒，沙粒上面铺营养土。通过石子层，实行膜上、土下渗灌，并调控好苗床光照、温度，搞好病虫害防治，促成壮苗。
（5）黄瓜秧苗移栽时，须用3000倍液的99%天达恶霉灵加2000倍液的2.5%高效氯氟氰菊酯药液、2000倍液的2%阿维菌素药液细致喷洒苗床和秧苗，做到净苗入室。栽后及时用1000倍液的天达2116壮苗灵+3000倍液的99%天达恶霉灵、500～1000倍液的旱涝收+3000倍液的99%天达恶霉灵药液灌根，每株100～150毫升；10天后再以1000倍液的天达2116壮苗灵、或+1000倍液的旺得丰土壤改良剂或奇多念等生物菌水溶液灌根，促进根系发达、抑制病原菌生长发育、提高植株抗性。以后结合根外追肥和防病用药，掺入600～1000倍液的天达2116或康凯等药液喷洒植株。每10～15天1次，连续喷洒4～5次，促进黄瓜营养体的生长发育，提高光合效率，增根壮秧，增强植株的抗病性和适应性能，减少发病或不发病。
（6）实行黄瓜与豆类等其他作物轮作，恶化病菌的生态条件，减少侵染。
（7）增施生物菌有机肥料、磷、钾肥料和中微量元素肥料，调整好植株营养生长与生殖生长的关系，维持植株健壮长势，提高黄瓜植株的抗病性。
（8）一旦发现病害，要针对病害种类，立即采取果断措施，对症下药，坚决彻底铲除之。绝不可让其滋生、蔓延。
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