三者的性质，职能，检查对象都不一样。
审计机关是依照法律，对国家各级行政机关、金融机构、企业事业组织进行财务收支、财经法纪、建设项目进行的经济监督。
纪检即监察机关，是人民政府行使监察职能的机关，依法对国家行政机关、国家公务员和国家行政机关任命的其他人员实施行政监察。
巡视组，就是“中央纪委中组部巡视组”的简称。2003年“中央纪律检查委员会、中央组织部”巡视组正式成立，设立5个巡视组，标志着巡视工作进入正式运作阶段，2009年更名为中央巡视组。巡视组的巡视对象主要是领导干部。巡视组主要负责对党委和政府党组领导班子及其成员进行巡视；对党组领导班子及其成员进行巡视。
审计、纪检、巡视组的性质，职能，检查对象都不一样。
一、审计
一般分为三类：政府审计、民间审计（注册会计师审计）、内部审计。
1、政府审计是政府的一个部门，叫做审计署（局）。政府审计主要针对国有资产。
2、民间审计独立于任何部门，一般叫第三方机构。现代企业制度使得企业的所有权（股东）和经营权（经理）是分离的。股东为了掌握经理经营的状况就需要请专门独立机构来查账。这里的专门独立机构，就是注册会计师。也有很多政府部门（比如税务）想掌握企业的真实情况，一般会要求企业出具注册会计师的审计报告。或是新开公司时，也需要注册会计师来帮忙进行验资。
3、内部审计是企业内部的一个部门，就像财务部一样。这个审计部主要检查企业的账务合理与否的情况，并进行监督。审计，就是检查会计账务是否符合相关会计准则（制度）的工作。
二、纪检
纪检主要负责全党的纪律检查工作，维护党的章程和其他党内法规，协助各级政府加强党风建设，检查党的路线、方针、政策和决议的执行情况。
1、受理党员的控告和申诉。受理对国家行政机关及其公务员、国家行政机关任命的其他人员违反行政纪律行为的控告、检举。
2、检查和处理国家行政机关各部门、企业内部党的组织和政府管理的党员领导干部违反党的章程和其他党内法规的案件，决定或取消对这些案件中党员的处分，必要时直接查处下级党的纪律检查机关管辖范围内的比较重要或复杂的案件。
3、对党员和国家行政机关工作人员进行党风廉政和遵守纪律的教育；做好党的纪检，行政监察工作方针、政策和法律法规的宣传工作；组织和指导纪检监察系统干部的培训工作。
三、巡视组
巡视组，就是“中央纪委中组部巡视组”的简称。主要工作就是巡视了解、巡视汇报、巡视反馈、移交督办。
1、巡视了解：向被巡视地区、单位通报巡视目的和任务，公布巡视组监督的范围、工作安排和联系方式，通过各种渠道了解被巡视地区、单位存在的问题。巡视期间，发现领导干部涉嫌严重违纪违法等问题，及时向中央巡视工作领导小组报告。
2、巡视汇报：巡视了解结束后向中央巡视工作领导小组报告巡视情况，主要反映巡视发现的问题、提出意见建议。
3、巡视反馈：向被巡视地区、单位反馈巡视发现的问题，提出整改的意见建议。反馈工作应体现从严治党的精神，严肃认真，形成震慑
4、移交督办：对中央巡视工作领导小组决定的事项，依据干部管理权限和归口管理、各司其职的原则，分别移交中纪委、中组部有关部门或中央有关职能部门处理并及时督办。对被巡视地区、单位的整改情况，以适当方式开展监督检查。
审计部门和监察部门的区别：
审计机关是依照法律，对国家各级行政机关、金融机构、企业事业组织进行财务收支、财经法纪、建设项目进行的经济监督。
监察机关是人民政府行使监察职能的机关，依法对国家行政机关、国家公务员和国家行政机关任命的其他人员实施行政监察。
审计机关的职责：
（1）、对本级各部门(含直属单位)和下级政府预算的执行情况和决算，以及预算外资金的管理和使用情况，进行审计监督；
（2）、地方各级审计机关分别在本级行政首长和上一级审计机关的领导下，对本级预算执行情况进行审计监督，向本级人民政府和上一级审计机关提出审计结果报告；
（3）、对国有金融机构的资产、负债、损益，进行审计监督；
（4）、对国家事业组织的财务收支，进行审计监督；
（5）、对国有企业的资产、负债、损益，进行审计监督；
（6）、对与国计民生有重大关系、接受财政补贴较多或亏损数额较大的国有企业和国有资产占控股地位或主导地位的企业的资产、负债、损益，进行审计监督；
（7）、对国家建设项目预算的执行情况和决算，进行审计监督；
（8）、对政府部门管理的和社会团体受政府委托管理的社会保障基金、社会捐赠资金以及其他有关基金、资金的财务收支，进行审计监督；
（9）、对国际组织和外国政府援助、贷款项目的财务收支，进行审计监督；
（10）、对其他法律、行政法规规定应当由审计机关进行审计的事项，依照和有关法律、行政法规的规定进行审计监督；
（11）、对与国家财政收支有关的特定事项，向有关地方、部门、单位进行专项审计调查，并向本级人民政府和上一级审计机关报告审计调查结果；
（12）、对各部门、国有金融机构和企业事业组织的内部审计，进行业务指导和监督；
（13）、对社会审计机构的业务质量，依照有关法律和国务院的规定进行监督；
（14）、承办本级人民政府和上级审计机关交办的其他事项；
（15）、此外，根据国家有关规定，审计机关还负责对县级以下的党政领导干部、国有企业及国有控股企业领导人员进行任期经济责任审计。
监察机关的职责：
（1）检查国家行政机关在遵守和执行法律、法规和人民政府的决定、命令中的问题；
（2）受理对国家行政机关、国家公务员和国家行政机关任命的其他人员违反行政纪律行为的控告、检举；
（3）调查处理国家行政机关、国家公务员和国家行政机关任命的其他人员违反行政纪律的行为；
（4）受理国家公务员和国家行政机关任命的其他人员不服主管行政机关给予行政处分决定的申诉，以及法律、行政法规规定的其他由监察机关受理的申诉；
（5）法律、行政法规规定由监察机关履行的其他职责。
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