孙中山是埋在了南京的中山陵。
孙中山先生在民国十四年，也就是1925年的时候因为肝癌在北京去世，在去世之前孙中山签署了《国事遗嘱》、《家事遗嘱》和《致苏俄遗书》等三个文件。
其中在国事遗嘱当中，他总结了自己四十年的革命经验，得出了一个结论，就是必须要唤起民众，联合全世界，以平等来对待中国，共同奋斗。
并且发出了革命尚未成功同志仍需努力的口号。在1929年，孙中山先生的遗体从北京迁移到了南京紫金山南麓的中山陵里面。
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孙中山逝世后的第三天，遗体被运到北平协和医院进行防腐处理，然后被装殓在一副美式楠木棺中，这是孙中山的第一副棺材。
孙中山遗体入殓后不久，孔祥熙嫌这副楠木棺材太小，又换了一副大的楠木棺。这副楠木棺为椭圆形，前端呈方形，棺中用玻璃作隔层，揭开棺盖可瞻仰孙中山的遗容。
这是孙中山的第二副棺材，称楠木玻璃棺。孙中山临终前说，愿如友人列宁那样保存遗体，供后人瞻仰。所以，在他逝世后，治丧处即向苏联定购水晶棺。
1925年3月30日，苏联赠送了一副水晶棺。该棺长1.75米，高0.5米，棺头0.65米，棺尾宽0.53米。棺的外盖及外层匀系钢质镀镍，银光闪亮。
但经专家检查，此棺质地较脆，且易于传热，加之长途运输，稍有裂隙，便会对棺内遗体产生影响，所以后来没有使用。此后停放在北平碧云寺中山纪念堂，供人瞻仰。这是孙中山的第三副棺材。
孙中山的第四副棺材是从美国定购的紫铜棺。这副紫铜棺长2.24米，宽0.8米，高0.65米，制作考究，外形精美，价值1.5万两白银，于1925年8月运到上海孙中山先生葬事筹备处，宋庆龄看后很满意。
1927年4月，上海葬事筹备处迁到南京，紫铜棺也运到南京。1928年12月30日，紫铜棺被运往北平。
1929年5月22日，国民政府在北平西山碧云寺为孙中山举行了隆重的换棺仪式，孙科请协和医院医生史蒂芬带领助手郭荣勋和一名护士将孙中山的遗体揩拭清洁，加裹白绸，并理发，然后由孙科、郑洪年、马湘为其穿了内外衬衣、礼服、鞋袜，戴上手套。
其殓服为白绫内衫、白绫内裤、白丝袜、黑缎鞋，外加素蓝纱袍、黑素缎马褂、白丝手套。穿戴整理完毕之后，孙中山遗体被小心地移入紫铜棺内。
棺四周放白绸棉垫和白绸丝棉袋，身上盖锦缎方被。1929年6月1日，紫铜棺柩运到中山陵，由孙中山的8名卫士抬入墓穴安葬。
换下来的那副楠木玻璃棺，放入了孙中山的衣服、鞋袜后，被封入北平西山碧云寺石塔内，胡汉民为之题写了孙中山先生衣冠冢石碑。第一副楠木棺则存放在北平中法中学。
参考资料来源：百度百科—孙中山
1925年3月12口，孙中山先生在北京逝世，遵照他生前安葬在钟山的遗愿，灵柩暂停放在北京香山碧云寺内，并决定在南京钟山修建他的陵墓。中山陵自1926年春动工，至1929年夏建成。中山陵坐北朝南，面积共8万余平方米，其中祭堂为仿宫殿式的建筑，建有三道拱门，门楣上刻有“民族”、“民权”、“民生”匾额。祭堂内放置孙中山先生大理石坐像，壁上刻有孙中山先生手书《建国大纲》全文。中山陵主要建筑有牌坊、墓道、陵门、碑亭、祭堂和墓室等。从空中往下看，中山陵像—座平卧在绿绒毯上的“自由钟”。半月形广场是钟顶圆弧，而陵墓顶端墓室半球形的穹隆顶，就像一颗溜圆的钟摆锤，整个大钟含有“唤起民众，以建民国”之意。中山大道／包括中山北路、中山路、中山东路)是原来的迎柩大道，也是南京第一条柏油马路，1926年动工，1929年完成。当时，孙中山先生葬事筹备处广泛征集陵墓设计方案，结果，建筑师吕彦直设计的“自由钟”式图案荣获首奖。吕彦直先生还被聘请为陵墓总建筑师。这组建筑，在形体组合、色彩运用、材料表现和细部处理上，都取得很好的效果，增强了庄严的气氛。
陵墓人口处有高大的花岗石牌坊，上嵌有孙中[山先生手书“博爱’’两个金字，点出了孙中山先生博大的胸怀和崇高的理想。石坊后是长达375米、宽40米的墓道。前行为陵门，它以青色的琉璃瓦为顶，门额上为孙中山的手迹“天下为公”四个大字。这里用青色的琉璃瓦有其一定的含意，青色象征苍天，青色琉璃瓦乃含“天下为公”之意，以此来显示孙中山先生为国为民的伟大志向。再前行为碑亭，一块高约6米的碑石上，刻着“中华民国十八年六月一日中国国民党葬总理孙先生于此"24个鎏金大字。从牌坊开始上达祭堂，共有石阶392级，8个平台。台阶用苏州花岗石砌成。攀登如此多的石阶较为艰难，但当走完这段长距离陡峻的石阶以后，一定会悟出《总理遗嘱》中“革命尚未成功，同志仍需努力”的含义。最高的平台有华表两座，华表为柱状标识物，标志祭堂即在此。
祭堂有三个拱门，分书“民族”、“民权”、“民生”门额。这是一座仿宫殿式的祭堂，门楣上刻有孙中山手书“天地正气”四字，表达了孙中山先生奋斗的理想。堂中有中山先生大理石坐像，高4．6米，逼真生动，是波兰著名雕刻家保罗·兰窦斯基的杰作。像座东西面有反映中山先生革命事迹的浮雕。祭堂东西护壁大理石刻着中山先生手书的遗著《建国大纲》和胡汉民等人书写的《总理遗嘱》。
堂后有墓门二重，两扇前门用铜制成，门框则以黑色大理石砌成，上有中山先生手书“浩气长存”横额。二重门为独扇铜制，门上镌有“孙中山先生之墓”石刻。进门为圆形墓室，直径18米，高11米。中央是长形墓圹，里面是中山先生汉白玉卧像，瞻仰者可围绕汉白玉栏杆俯视墓圹里的卧像，此像系捷克雕刻家高棋按遗体形象塑造，十分逼真。
卧像下面安葬着孙中山先生的遗体。墓圹直径4米，深5米，外用钢筋混凝土密封。南京解放后，刘伯承任南京市市长时，特地从湖南运来2万株杉树和梧桐树，种植在墓室周围。
中山陵园整个园林面积达3000多公顷。陵墓周围，郁郁葱葱，景色优美。孙中山先生虽然与世长辞，但是他浩气长存，永远为世人敬仰。到南京游览的人，一般都要到中山陵瞻仰这位伟人。中山陵的建筑风格中西合璧，设计非常成功，钟山与牌坊、陵门、碑亭、祭堂和墓室，通过大片绿地和宽广的台阶，连成一个大的整体，既有深刻的含意，又显得十分庄严雄伟，所以中山陵被誉为“中国近代建筑史上的第一陵”本回答被网友采纳
今天正好是中山先生的奉安大典80周年纪念日。