总面积杭州比南京大。
南京市总面积6597平方公里， 市区面积4737平方公里；杭州市总面积16596平方公里,其中市区面积3068平方公里。所以杭州比南京大， 但是杭州市区面积比南京的小。因为地形造成的，杭州市内山水比南京多，所以城市市区范围不会扩张很大。
南京和杭州这两城，同是处于华东地区，都是依山傍湖，南京有长江，杭州有钱塘江；南京有玄武湖，杭州有西湖；南京有秦淮河，杭州有京杭大运河，这两座城市的江河湖山的分布几乎如出一辙。
南京和杭州都是万亿俱乐部的城市，经济发展水平不相上下，杭州稍微领先南京一点，但是未来潜力看的话还是南京，南京是高铁城市，至少有四条以上高铁经过南京，南京区位优势、教育资源、发展规划方面都比杭州要好。杭州在浙江省内是一城独大，这是杭州有优势的一面。