重庆交通大学河海学院的历史可以追溯到1960年，当时是重庆交通学院的水道及港口工程系。这个专业在1985年开始接纳硕士研究生，进一步发展。1997年，水港工程系更名为河海建筑工程系，随后于2003年独立成立了河海学院。学院目前拥有一个一级博士点，五个二级博士点，以及两个一级硕士点和十个二级硕士点。其中，'港口、海岸及近海工程'被列为重庆市的重点学科。学院在水利领域具备工程硕士专业学位的授予资格，设有'港口航道与海岸工程'、'水利水电工程'、'环境科学'和'地质工程'等七个本科专业。
学院师资力量雄厚，共有108名专任教师，其中包括22位教授和42位副教授（副研究员）。学院的教师队伍中，不乏新世纪'百千万人才工程'国家级人选、交通部科技英才、重庆市学术技术带头人和重庆市名师等杰出人才。学院一直注重学生的全面发展，学生凭借出色的能力和综合素质，普遍受到社会和用人单位的赞赏。近五年来，毕业生初次就业率始终保持在90%以上。
经过50多年的辛勤耕耘，河海学院已经为国家培养输送了数千名本科和硕、博士毕业生。这些校友中有许多已经成为知名学者、科技骨干、企业精英和领导干部，学院的教育质量和办学水平得到了社会的广泛认可和赞誉。
重庆交通大学河海学院前身是创建于1960年的重庆交通学院水道及港口工程系，1985年开始招收硕士研究生，1997年水港工程系改名为河海建筑工程系，2003年成立河海学院。河海学院现有1个一级博士点，5个二级博士点，2个一级硕士点，10个二级硕士点及7个本科专业。