第五回宝玉神游太虚幻境，见着金陵十二钗的判词，正册第五便是妙玉：
欲洁何曾洁？云空未必空。可怜金玉质，终陷淖泥中。
然后，在十二支“红楼梦”曲中有一支《世难容》，也是写妙玉：
气质美如兰，才华馥比仙。天生孤僻人皆罕。
你道是啖肉食腥膻，视绮罗俗厌；却不知好高人愈妒，过洁世同嫌。
可叹这，青灯古殿人将老，辜负了，红粉朱楼春色阑！
到头来，依旧是风尘肮脏违心愿；好一似，无瑕白玉遭泥陷；又何须，王孙公子叹无缘？
妙玉本也是有钱人家是小姐，因缘际会，来到贾府，带发修行。虽是仰仗着别人生活，但妙玉却自带一种凛然不可侵犯的高洁气质。时间久了，贾府上下也都知晓她的脾性，轻易没人去栊翠庵打扰她，她也乐得清静。
只是，这清静中可有孤寂？孤寂本是人生常态，是人都难免。但有的人总想着用声色耳目之娱来弥补，而有的人则将之化作一种享受。妙玉偶尔也走出栊翠庵，比如黛玉、湘云在凹晶馆联诗那晚。两个人联诗联得好好的，妙玉突然走出来，制止二人继续往下做，说“太悲凉”，然后自己续了几十句。这一节既可见妙玉超然的气质，也可见她莫测的才华。因为她终究是个修心的方外之人，所以，像这样一展才华的时刻少之又少。
除去妙玉与众不同的气质和才华，大家最关心的是，她和宝玉之间的感情：他们究竟有没有小小的哪怕是那么一丁点儿的暧昧？
如果有，怎么说？如果没有，“王孙公子叹无缘”中的“王孙公子”又是谁？
宝玉欣赏、怜惜妙玉，这是肯定的。刘姥姥杜撰的雪中抽柴的小姐、去袭人家做客的姨姐妹、村庄纺线的二丫头，都让宝玉念念不忘，何况是“金玉质”的妙玉？对妙玉的欣赏、怜惜只是宝玉的天性使然。妙玉呢？她对宝玉如何？
刘姥姥一进大观园那回，贾母带着众人去了栊翠庵，宝玉“留神看她是怎么行事”。妙玉给老太太献茶后，就不管那群人了，单单邀请了黛玉、宝钗两个出众的女孩子去她的耳房，“宝玉悄悄的随后跟了来”。宝玉为什么敢跟过去？一是，他了解妙玉的为人，他不用跟妙玉客气；二是，他们之间有默契，妙玉不用跟他客气。果然，妙玉一点也不好奇宝玉无邀而进了她的耳房。
妙玉要扔掉刘姥姥用过的杯子，黛玉、宝钗都无话。可见她做这样的事大家都习以为常，觉得劝说无益，或者说她们自己也觉得应该这样。独宝玉“赔笑”劝她不如赏了刘姥姥。妙玉竟然依允，虽然她为自己找了借口“幸而那杯子是我没吃过的”，但不妨碍大家由此看出宝玉的面子之大。
所以后来在芦雪亭联诗的时候，宝玉落第受罚，李纨罚他去找妙玉要红梅。她说：“我才看见栊翠庵的红梅有趣，我要折一枝来插瓶。可厌妙玉为人，我不理他，如今罚你取一枝来，插着玩儿。”李纨先是叫人跟着宝玉，被黛玉阻止了：如果有人，反倒要不来红梅。李纨点头说是。从这里可看出，妙玉的确是“孤僻人皆罕”，然而她对宝玉总能例外。好在林黛玉也是个理解她的人。
果然，宝玉顺利完成任务，取回一枝红梅。虽如他所说“不知费了多少功夫”，但换做其他人，只怕是费再多功夫，也未必能得。
还有宝玉的生日。妙玉这个“槛外人”竟然会给他送来一纸生日祝福，这是何等不寻常之事！难怪宝玉为个回帖为难得坐卧不安，不易得的东西当然最珍贵，妙玉何曾主动给其他人送字帖？
因为这些，所以有人觉得二人之间必有些小暧昧。
并没有。
妙玉待宝玉的确不同，但那是因为，宝玉值得。妙玉不止心性高洁，她更是个有慧根的人，她必定善于识人。宝玉的不凡之处，她未必不比黛玉看得清楚。她既然以贾府为依靠，少不了要和贾府之人打交道，既然如此，何不和那些值得交往的人相交？黛玉、宝钗是人品出挑的，自然入得她的眼；邢岫烟跟她有旧日情分且又懂她，也不必说；宝玉是第一等纯粹的人，又怎能错过？何况，宝玉的那些声名远扬的事迹，妙玉想必也早已听说，她懂他，所以更愿意和他结交。
人生在世，无论多么孤寂，清苦，但若有一二知己相伴，也不枉这一世。宝玉之于妙玉，是朋友，是知己。他们之间的情谊，只有真诚无暇的友情，并无一点暧昧。
那只杯子是妙玉很旧以前用的,而且她有洁癖,杯子肯定是洗得很干净.妙玉把自己的杯子给宝玉用,只是欣赏他的才华而已.
其实从人物的性格可以分析的出来没有，妙玉清高，认为普天之下充满俗气，自是不把自己当作一般女子，而宝玉在这群女子面前从来都认为自己是个浊物，在妙玉面前更是自惭形秽。所以不可能发生这样的事情。