一、 招生对象的区别
自考专升本报考条件基本上没有限制，对年龄，专业，学历层次等均无限制，无论是专科在读还是专科毕业生都可以报考，不过自考本科申请毕业时需要有国家承认的专科学历文凭。
而函授本科主要招收在职从业人员，函授本科也分高起本和专升本，报考高起本需要具备高中及以上学历文凭，报考专升本需要具备国家承认的专科学历证书。
二、 学习考试的区别
自考专升本没有入学考试，只需要在每次考试前到当地自考办或当地的教育考试院官网报名即可，报几科考几科。专升本是专科起点升本科，除统招专升本外，其他专升本是您的第二学历，而您的第一学历是专科（统招专升本第一学历为本科）。
函授本科属于成人高考，需要参加每年的全国统一考试，录取后方可进行函授学习，在学习期间通过课程期末考试，达到毕业条件方可申请毕业。
在学习方式，自考以自学为主，学生也可以选择报班来辅导学习。函授是以自学+集中面授为主学习方式。
三、考试难度的区别
自考专升本需要考完专业的所有科目，并且全部及格才可以申请毕业证，有一定的难度，含金量及社会认可度也是所有成人学历里面最高的。
成人高考函授本科除了参加需要参加国家统一组织的考试以外，入学后的考试均为校考课，考试难度不大，毕业相对容易。
四、 学习年限的区别
自考专升本没有学制年限，考生什么时候全部考完什么时候申请毕业。一般为2-3年，快的话1.5年考完即可申请毕业。时间不定，看学生自己的考试通过情况。统招专升本一般要读三年专科，两年本科，总共5年。普通本科大部分是四年制。对于除统招外的其他专升本可能需要更少的时间。
函授本科是有学制限制的，高起本学制为5年，专升本学制为3年。不可提前，可申请延期毕业。
五、毕业证书的区别
自考专升本的毕业证书是由主考院校和当地自考委员会联合颁发的高等教育自学考试毕业证书。
而函授本科则由报考院校颁发的成人高等教育毕业证书，盖报考院校学校章，毕业证上标注“函授”字样。