明代十六朝，北京十三陵只13座墓，缺三帝。
一是
明太祖朱元璋 明孝陵位于南京市玄武区紫金山南麓独龙阜玩
珠峰下，东毗中山陵，南临梅花山，位于钟山风景名胜区内，是明朝开国皇帝明太祖朱元璋与其皇后的合葬陵墓。因皇后马氏谥号“孝慈高皇后”，又因奉行孝治天下，故名“孝陵”。
二是
建文帝 仁柔寡断的建文帝即位后，将
朱棣三子“扣”于南京，叔侄间剑拔弩张。朱棣装疯卖傻请求建文帝归还其子之后，起兵反抗，以“清君侧、靖国难”为借口，挥师南下讨伐，史称：“靖难之役”。后朱棣挥师渡江攻破明朝京城南京，战乱中建文帝下落不明。
三是
景泰帝朱祁钰。土木堡之变中
明英宗被俘，危急关头朱祁钰被于谦等拥立登基，是为景泰帝。不久明英宗放回，被幽禁于南宫。后来英宗发动夺门之变复位，废祁钰为郕王。祁钰死后以亲王礼葬于北京西山。