一、利用国家对农产品的特殊优惠政策进行筹划
《中华人民共和国增值税暂行条例》(以下简称《暂行条例》)第十六条规定：农业生产者销售自产农业产品免征增值税。具体来说是指对直接从事种植业、养殖业、林业、牧业、水产业的单位和个人销售自产的初级产品免征增值税。同时考虑到某些一般纳税人购进这些农产品没有办法抵扣，因此《暂行条例》又规定：自2002年1月1日起，一般纳税人向农业生产者购买的免税农业产品，或向小规模纳税人购买的农业产品，准予按照买价和13%的扣除率计算进项税额，从当期销项税额中扣除;但对于使用自己生产的农产品不准抵扣进项税额。该政策中便存在一定的可筹划空间。
具体增值税税收筹划方法是：如果增值税一般纳税人用自行生产的农产品(包括畜产品)继续生产工业产品，应当将农产品的生产分设为独立的法人机构，将农产品的连续加工改为独立企业之间的购销关系，以适用抵扣进项税的规定。如一家乳品厂既有牧场养奶牛，又有乳品加工车间，将原奶加工成含不同成分的袋装、盒装牛奶出售。按现行税制规定，该类企业为工业生产企业，不属农业生产者，其最终产品不属农产品，不享受农业生产者自产自销的免税待遇。按增值税税法规定，这类企业可以抵扣的进项税额主要有饲养奶牛所消耗的饲料。饲料包括草料和精饲料，草料由农场自产和向农民收购。但只有向农民收购的草料，经税务机关批准后，才能根据收购凭证按收购额的13%抵扣进项税额。由于精饲料在上一环节是免税(增值税)产品，而本环节又不能取得增值税专用发票，当然不能抵扣税额，但其最终产品——加工出售的各种成品牛奶，应按17%计算销项税额。这样，其实际增值税税负往往超过了13%。为此，企业可以经过有关审批手续，将牧场和乳品加工厂分为两个独立的企业。虽然原来的生产程序不变，但经过工商登记后，都成了独立法人。牧场生产销售原奶，属自产自销农产品，可享受免税待遇，销售给乳品加工厂的原奶按正常的成本利润率定价。分立后的乳品加工厂从牧场购进原奶，可作为农产品收购的税务处理，按专用收购凭证所记收购额的13%计提进项税额，销项税额的计算不变，其税负可大为减轻。
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