细菌的分子鉴定,需要我们选择什么样的一段
DNA分子呢?
他必须符合几个特点:
1. 在所有菌株中都存在,要不没法比(最好在所有物种中都存在或者相近的存在);
2. 在进化中相对保守,执行相同或相近的功能;(执行相同的功能才能在进化压力下相对保守,只有相对保守,有一个稳定的架构才能比较亲缘,要不然鸡跟鸭没法比)
3. 有一定的信息量,序列太短了信息量太少,无法很好的比较;
4. 便于序列分析,(别太长了,太长了增加技术难度和准确性)
核糖体是在所有细胞形式生命中都存在,而且功能相同(合成多肽链)。所以核糖体rRNA的DNA序列相对保守,是较理想的进化、亲缘分析的对象。
其中5S rDNA太短信息量不足,;
16S rDNA一般有1.5 kbp够长了;而23S rDNA太长不便分析;所以一般我们都是以16S rDNA作为菌株鉴定的分析对象