在这四大组织中，要论谁的权力最大，可以先把六扇门排除在外，从某种意义上说它的权力最小，而东厂、西厂和锦衣卫的权力大小要分皇帝及其厂卫首领，也就是说这三个组织，都曾经当过老大，也都低沉过，下面我们就来详细说一下。
先说六扇门，其实在明朝没有任何一个衙门叫“六扇门”，“六扇门”应该就是当时的老百姓对司法衙门的称呼。明朝的六扇门其实指的是三法司，也就是刑部，大理寺和都察院三个衙门，这三个衙门分别负责对全国案件的审理，复核和监督。如果还是不清楚，用今天的观点来看，刑部就相当于相当于现在的公安部，大理寺相当于今天的最高人民法院，督察院相当于今天的最高人民检察院。
一般来说，“六扇门”也就是三法司的衙门还是依照相关律法规则办事，手段也比较光明正大，没有那么耸人听闻。
再说锦衣卫，他们曾经跟随太祖朱元璋南征北战。后来明朝成立后，他们分编为“拱卫司”“仪鸾司”，就是皇帝身边的仪仗和侍卫，是天子亲军。后来朱元璋为了监视天下百官，把这两司合并为锦衣卫，飞鱼服和绣春刀就是他们最显眼的标志。
锦衣卫最辉煌的时候是在太祖朱元璋时期，他作为朱元璋手中最锋利的一把刀，拿了不少贪官污吏，使得当时的官员臣民一提锦衣卫无不为之色变。后来因为锦衣卫权力太大，并且名声不好，朱元璋曾经一度废除了锦衣卫，直到明成祖朱棣为帝，锦衣卫又重新恢复往日荣光。
然而朱棣不仅重建了锦衣卫，也建立东厂来监管锦衣卫。自正统皇帝之后，锦衣卫表面上与东厂是平级，实际上锦衣卫地位低于东厂。但是嘉靖年间，嘉靖皇帝十分厌恶宦官干政，于是锦衣卫的权力又达到了顶峰。在陆炳执掌锦衣卫的时候，锦衣卫曾一度压倒东厂。但嘉靖皇帝后，锦衣卫又长期弱于东厂。
然后是东厂，明成祖朱棣是通过靖难之役登上了皇位后，比较信任身边的人，特别是太监。比如著名的”三宝太监“郑和。于是他专门成立了“东缉事厂”，这就是“东厂”。
东厂也是监视文武百官及乡绅，并且同时也监视锦衣卫。东厂可以直接逮捕、刑讯相关人犯，所以权力很大，长期凌驾于锦衣卫之上。正统皇帝在位时的王振、正德皇帝在位时的刘瑾、万历皇帝在位时的冯保、天启皇帝在位时的魏忠贤，都是东厂的最高头目，鼎鼎有名。
最后是西厂，西厂是成化年间设立的，大太监汪直为首任厂督。西厂活动范国全国，监察文武百官和百姓。并且监视东厂和锦衣卫，权势又在东厂之上。
因为皇帝的大力支持，西厂短短几个月内，势力超过了东厂，可谓权势滔天。然而西厂设立5年后，因遭反对，被迫撤销。正德皇帝曾经短暂复开，后来又被撤销。西厂总共只有两任提督，分别是汪直和谷大用，也是历史有名的大太监。
总的来说，”六扇门“权力相对较弱，因为他受到很多规则制约。东厂、西厂、锦衣卫都辉煌过。这三者同时存在的时候，西厂最厉害。