随着卫生体制改革的不断深入，卫生监督职能将从
疾病控制中心分离出去，
疾控中心工作性质和职能将发生历史性转变。疾控中心必须及时转变观念，建立现代科学治理机制，加强自身建设，提高疾病预计控制和卫生技术服务水平，更新仪器设备，改善检测环境和条件，注重检验标准、质量控制的研究，努力使我们的卫生检验工作与国际接轨。从单一病种的防治向综合防病模式转移，运用现代疾病控制技术，对本地区易发疾病的发病规律、趋势和动态、相关因素，进行调查，分析，科学研究和猜测评估，为政府调整疾病预防、控制策略、拟订规范化疾病控制方案和技术决策提供科学依据。从急性传染病防治向慢性病防治转移，在严格控制急性传染病的同时进一步加强慢性病的防治，将艾滋病及
心脑血管病、肿瘤等危害大的疾病作为控制慢性病的重点目标，从卫生执法转移到以人群健康与环境、职业等因素为主要内容的“人群—环境—健康”研究，对可能造成健康影响的环境因素进行调查研究；开展环境健康影响评估以控制环境危险因素为主导，开展干预工作。依据《
职业病防治法》加强职业病治理，在做好职业人群健康体检的同时加大力量开展健康人群的健康体检；积极开展中毒和意外伤害控制。根据本地疾病谱的变化，开展其他常见病、缺碘病的防治。只有这样才能保证卫生防疫工作适应社会主义的新形势，才能为“
十六大”提出的“全面建设小康社会，开创中国特色社会主义事业新局面”保驾护航。