网上药店只要是指定的医疗机构支持医保卡，都可以使用医保卡。
1、定点医疗机构于每月10日前，将上月出院患者的费用结算单、住院结算单及有关资料报医疗保险经办机构，医疗保险经办机构审核后，作为每月预拨及年终决算的依据。
2、医疗保险经办机构每月预拨上月的住院及特殊病种门诊治疗的统筹费用。
3、经认定患有特殊疾病的参保人员应到劳动保障部门指定的一家定点医疗机构就医购药，发生的医药费用直接记帐，即时结算。
4、急诊结算程序：参保人员因急诊抢救到市内非定点的医疗机构及异地医疗机构住院治疗，发生的医疗费用，先由个人或单位垫付，急诊抢救终结后，凭医院急诊病历、检查、化验报告单、发票、详细的医疗收费清单等到医疗保险经办机构按规定办理报销手续。
扩展资料：
一、医保卡的主要用途
（1）医保最主要的用途就是门诊看病付钱。
（2）医保还有其他用处，可以用这些钱在定点药店买药（非处方药物），医疗器械，体温计和血压仪等这些辅助检查设备。
二、医保卡的使用流程
首先，医保卡有3个作用，一是看门诊用来刷卡付费，二是药店买药，三是住院时出示医保卡，住院费用记账部分自动划走。
参保人在看病、挂号时就可出示社保卡，看病费用如果属于医保范围内的费用直接在卡内扣除，并且每年会根据缴费金额的不同在参保人卡内注入资金(一般一年在500元人民币左右)，当参保人卡中的余额扣完后，就进入自付段，这时看病都是要自己付费的。
（1）买药：在一般的医保指定药店，我们买药时可以用医保卡直接刷卡支付就可以了。但要保证医保卡里有足够的钱，如果钱不够要自己再把钱补上。
（2）住院：一般情况下，患病住院时需要出示医保卡及身份证到医保定点医疗机构，即可享受医保待遇。如果生大病需要住院治疗，只要把卡交给医院，就可以安心治疗了。卡里面一分钱没有也没关系。
出院时医院会和医保中心结算，个人只需负担三分之一的费用。 即：用个人账户支付个人自付部分，统筹报销部分由医保中心与医院结算。
参考资料来源：百度百科_社会医疗保险卡
参考资料来源：人民网_网上买药能刷医保卡了