高新技术企业认定审计一般每年1次且有有3个时点需要审计报告：第一、每年1次审计报告。依据是根据《高新技术企业认定管理工作指引》（国科发火〔2008〕362号）复审须提交近三个会计年度开展研究开发等技术创新活动的报告，经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构出具的近三个会计年度企业研究与开发费用、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告。3个时点依据是：《高新技术企业认定管理办法》（国科发火〔2008〕172号）第一是认定与申请享受税收政策时。 高新技术企业认定的程序规定提交申请材料包括“ 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度研究开发费用情况表（实际年限不足三年的按实际经营年限），并附研究开发活动说明材料”；“ 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务报表（含资产负债表、损益表、现金流量表，实际年限不足三年的按实际经营年限）以及技术性收入的情况表”。第二是认定期满3年时需要提前3各月申报复审。高新技术企业复审须提交近三个会计年度开展研究开发等技术创新活动的报告，经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构出具的近三个会计年度企业研究与开发费用、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计报告。第三是需要复核时。对高新技术企业资格及其相关税收政策落实产生争议的，属于对是否符合《高新技术企业认定管理办法》第十条（四）款产生争议的，应组织复核，即采用企业自认定前三个会计年度（企业实际经营不满三年的，按实际经营时间）至争议发生之日的研究开发费用总额与同期销售收入总额之比是否符合《认定办法》第十条（四）款规定，判别企业是否应继续保留高新技术企业资格和享受税收优惠政策。
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