根据有关规定，医保断交三个月不会清零，并且无论断交多长时间都不会作废。个人账户余额在重新缴纳医保后会激活，可以继续使用，也就是说个人缴纳的医保金额不会清零。但断交三个月以后，医疗保险会重新计算缴费年限。
而医保在连续缴纳满一定年限（男满25年，女满20年），在到达
退休年龄后，可享受免费医疗保险的待遇。所以建议大家，在一般的情况下，尽量不要断交医保超过三个月，以免影响到退休后的医保待遇。
拓展资料：
一、医保指社会医疗保险。是国家和社会根据
法律法规，在劳动者患病时基本医疗需求的社会保险制度。
2016年1月12日，国务院印发《关于整合城乡居民
基本医疗保险制度的意见》要求，推进城镇居民医保和
新农合制度整合，逐步在全国范围内建立起统一的
城乡居民医保制度。
2016年12月20日，人社部召开基本医疗保险全国联网和异地就医直接结算工作视频会，并与北京等22个申请首批启动基本医疗保险全国联网和
跨省异地就医直接结算的省份签订了工作责任书，标志着跨省异地就医直接结算工作正式转入落实阶段。
2021年6月，统计公报显示：2020年全国基本医疗保险参保人数136131万人，参保率稳定在95%以上。
二、社会医疗保险是国家和社会根据一定的法律法规，为向保障范围内的劳动者提供患病时基本医疗需求保障而建立的社会保险制度。
社会统筹医疗保险组成：缴费基数为M：员工工资性收入+津贴。单位每年交纳8%M；员工个人每年交纳2%M；
单位缴费8%M：6.6%M至7%M进入统筹账户（1%M至1.4%M进入个人账户）---住院费用；个人缴费工资的2%M:2%M进入个人账户（加上单位缴费1%M至1.4%M）---门诊费用。
注：住院费用从统筹账户中报销，金额每人都一样；门诊费用从个人账户（即
医保卡）中扣除，每人不一样。
三、2017年5月2日报道，
人力资源社会保障部和财政部发布通知要求2017年居民医保各级财政人均补助标准在2016年基础上新增30元，平均每人每年达到450元。2017年城乡居民医保人均个人缴费标准在2016年基础上提高30元，平均每人每年达到480元。