南京市六合区实验高级中学自2001年以后，步入了快速发展阶段，始终保持着和谐稳定的步伐，不断壮大并追求进步。学校投资建设了全新的教学楼、实验楼、综合楼以及学生公寓和餐厅，提供现代化的设施。400米标准的塑胶运动场和多片篮球场增添了运动空间，实验室、微机教室和多媒体教学设备一应俱全，所有教师配备了教学手提电脑，确保了高效的教学环境。学校的现代化设施使用率高，维护及时，管理规范，有效支持了教学活动的进行。
校园环境方面，经过几年的精心打造，校园内绿树成荫，花木繁茂，草坪小径错落有致，花香四溢。雪松和樟树常绿，广玉兰和紫叶李香气扑鼻，共同构成了美丽的校园景观。这些改善使学校的面貌焕然一新，提升了整体的教育品质。
2007年，学校又新增23亩土地，正在建设学生公寓、图书馆和艺术教学楼，总建筑面积大约13500平方米，工程进展顺利。如今，南京市六合区实验高级中学已发展成为一所大型学校，城区校区有52个教学班，横梁镇校区15个，分校34个，学生总数达到5292人（城区2812人，横梁镇717人，分校1763人），规模不断扩大，教育资源丰富。
南京市六合实验高级中学是一所新建不久、发展快速的高级中学，是六合区三所定点高中之一。学校于2001年7月由1957年创办的六合二中和1983年创办的六合四中合并而成；2001年被评为市重点中学，2004年平转为“省二星级高中”；2006年7月初中部剥离，成为独立设置的高级中学；2007年4月通过“省三星级高中”现场评估验收。