肠吸收不良综合征，又称消化吸收障碍综合征，其临床表现多样。最主要的症状是腹泻，由于未被吸收的营养物质影响肠道功能，可能导致腹胀、食欲不振，严重者还可能伴随夜尿增多。腹部不适和肠鸣音活跃也是常见症状，腹痛可能由慢性胰腺炎、肠梗阻或缺血引起。
体重减轻和乏力是由于营养吸收不足，患者可能出现体重下降、疲劳无力。长期营养不良可能导致生长发育迟缓甚至恶病质，低蛋白血症和水肿是由于蛋白质和血浆蛋白吸收不良引起的。严重腹泻还可能引起水电解质平衡紊乱，长期病程可引发营养不良、贫血和骨骼健康问题，如骨质疏松。
维生素和矿物质缺乏的症状也各不相同，如乳糖吸收不良导致的贫血、维生素K缺乏的出血倾向、维生素D缺乏的手足搐搦症、夜盲症等。糖吸收不良分为原发性和继发性，原发性如乳糖吸收不良，继发性则可能由肠炎、慢性腹泻等引起。脂肪吸收不良特征性症状包括腹泻、腹痛、腹胀及脂肪泻，可导致体重减轻、贫血和生长发育受阻。
蛋白质吸收不良相对少见，通常伴随其他营养物质的吸收障碍，表现为浅色粪便、恶臭和低蛋白血症症状，如水肿和腹水。整体而言，肠吸收不良综合征涉及多个营养物质的吸收障碍，症状复杂且多样，需要针对具体病因进行诊断和治疗。
肠吸收不良综合征是儿科发病率较高的一种疾病。幼儿因病理原因导致蛋白质、糖类、维生素等营养物质不能被小肠吸收，而直接排出体外。主要症状是食欲不振、腹泻及体重减轻等。