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测序回来的序列怎么对比
如何比对
基因组
测序
数据?
答:
1、网络搜索下载并安装BioEdit软件。2、将你所要比对的序列以fasta格式粘贴在文本文档里
。3、BioEdit软件打开文本文档,选中所有的序列,按下图方法选择要打开的标签。4、在新的窗口中,按下图所示勾选Note下面的方框(勾选之后可以在比对的结果中用星星表示,方便你看出哪些地方不一致)和运行“RunClustalW...
怎样
知道转录组
测序的
碱基
序列
是否正确
答:
与已知基因序列比对、利用生物信息学分析。
1、与已知基因序列比对:将测序得到的序列与已知基因序列进行比对,观察是否有明显的差异或错误
。2、利用生物信息学分析:通过生物信息学分析,如基因预测、转录因子结合位点分析、表达谱分析等,可以初步推断测序结果的准确性。
菌液
测序
结果
怎么比对
知道是正确的
答:
File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment 第三:比对结束后,删除
比对序列
两端的多余序列,使所有序列等长 选择需要编辑
的序列
Sequence Edit Sequence 进行序列的编辑 保存修改后结果 第四:选择 Sequence 菜单下的 Gaps ,点击 Lock Gaps 第五:将比对后的序列保存为Fasta 格式文档 4....
怎样
分析
测序
结果
答:
1.假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对
,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行.2.如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,...
我有一个
测序的
结果,可是我不会进行
比对
,能详细的告诉我一下步骤吗...
答:
下面以最基本的核酸
序列比对
来谈一下 BLAST的使用, 期间我也会含沙射影的说一下其他序列比对的方法。2. 点击Basic BLAST部分的nucleotide blast 链接到一个新的页面。打开后如图所示:介绍一下上述页面: Enter Query Sequence 部分是让我们输入序列的,你可以直接把序列粘贴进去,也可以上传序列,还...
...
序列
。在与GenBank数据库比对时,发现差异好大,请问
如何比对
...
答:
请问你是用质粒上多克隆位点附近的引物进行的
测序
吗?由于测序结果头部
序列
会受到荧光染料干扰会有几十BP序列不是很准确,你需要双向测序后进行拼接,连成一条链后再在数据库比对,或者是网上下载DNASTAR之类
的比对
软件来分析比对。
细菌16s rdna
测序
后
怎么比对
和构建系统发育树,详细的步骤啊,老师不管我 ...
答:
有很多方法,可以下载软件也可以在线构建。在线构建可将你的序列输入PUBMED的Blastn中进行对比,结果中有一种就是系统发育树,但里面残余
对比的序列
太多,逆序挑选一下。软件有很多,
比较
简单的是DNAstar中的Megalin,但结果比较粗。推荐用Clustal X软件进行同源性
比对
后,运用MEGA3.0软件进行系统发育分析并...
基因
测序
结果与应有
序列比较
是否一致,可以用什么软件来检测?
答:
这个直接到NCBI网页上,有个服务叫做BLAST,把
测序
得到的序列贴上去就可以了。http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 可以对2个序列进行比对,也可以和数据库中现有物种
的序列比对
。蛋白质氨基酸序列比对等等,很多功能,是目前功能最强大的序列比对系统。
测序
得到基因
序列
后
如何
分析呢 都需要用什么软件啊 新手 拜托高人指点...
答:
测序
得到基因序列后一般都需要进行
序列比对
,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。不用担心,多熟悉几遍就可以操作了,很简单的,要对自己有信心,加油!
如何
对已
测序
但其他信息未知
的序列
进行生物信息学分析
答:
blast吧,先
比对
碱基
序列
的同源性,再比对氨基酸序列的同源性。还可以看看序列中有没有rbs位点,以及起始密码和终止密码子等。如果有开放阅读框的话可以试着翻译一下,看看期蛋白质氨基酸序列。也可以用蛋白质结构预测软件分析其蛋白质高级结构
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