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测序回来的序列怎么对比
Day7--
测序
基础知识
答:
测序
深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M,测序深度为10X,那么获得的总数据量为20M。覆盖度是指测序获得
的序列
占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在,测序最终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域,这部分没有获得的区域就称为...
扩增出来
的序列测序
时出现一定程度污染,请问所
测序
列在校对时有多少不...
答:
楼主你好~一般看你要用这个
序列
做什么后续实验了,如果是要要研究这段序列的功能(比如它是启动子区域或者蛋白结合域),那么一个碱基都不能错,如果是做表达,只要是同义突变不影响氨基酸的话,3个以内还是可以容忍的。希望对你有帮助,望采纳,谢谢 ...
细菌鉴定
测序
结果无法建树
怎么
办
答:
12,如果你的有300 bp以上重复区域,下面
怎样
从这个比对文件中获取你的16S rDNA
序列
。你会注意到,生成
的比对
文件是分两行来进行的,上面是“up”,下面是“down互补”。下面你就复制“up”序列(只负责up的哦),贴到一个新建的word文档中,一直到那个重复区域的断点那里(约950 bp长度),然后从...
如何
根据DNA
测序
来判断蛋白质
的序列
答:
找到起始密码子和终止密码子,然后把中间的部分翻译成蛋白质
基因克隆和
序列
分析相关问题
答:
你
测序
所得峰图是否单一.如果不是单一峰图你
比对
有所差异很正常.如果为单一峰图存在差异原因:一是,PCR扩增过程中产生错误,其次,测序准确率的问题。由于测序仪准确率的限制,在一个较长
的序列
中发生碱基错误是难以避免的。在确认克隆准确无误的情况下,通过双向测序可以最大限度的减少测序的错误。只...
请问
怎样
剔除
测序
结果中的引物
序列
,进行BLAST
答:
因为Sanger
测序的
自动化应用限制,测序结果中是不可能出现引物序列的。只可能出现部分载体序列。但是如果使用的载体所推荐的测序引物,那测序结果中的载体序列一般不会太长,一般不影响BLAST结果。当然要是插入序列太短则可能在3‘端出现载体序列,与载体
序列比对
后直接手动删掉就好。 楼上说的vecscreen也确实...
回来的
DNA
序列
,
怎么
判断它的里面有没有引物序列
答:
什么意思?
测序
结果吗?测序结果里是没有引物
序列
的,因为PCR引物中不带有荧光基团,是不能被测序仪检测到的
细菌基因组重
测序
结果分析报告
怎么
看
答:
测序
只是最基础的,接下来你要做功能基因分析,查找确定哪一些是编码基因
的序列
,然后做表达检测。。 如果你事先知道自己的目的基因序列,测序结束后,应该可以直接找到。
求助大神:
如何
查找基因的保守或特异
序列
?谢谢
答:
上NCBI做BLAST,网址:网页链接 在页面左上角的方框里贴入基因
序列
,在下面的organism optional里面选择物种,点击最下面的BLAST按钮就行了。结果里面同源序列越多,就越保守。
...pcr后
测序
获得orf的后半段,
怎么
得到前半段?
答:
你先设计一段前半段的引物看看到底有没有正确的那部分
序列
吧。。
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