安徽华源医药股份有限公司前身为太和县医药公司，成立于1953年，90年代初期，由于各种原因，企业负债累累，濒临破产倒闭。1991年，以王军为首的新领导班子上任后，逐步走上了一条以整顿求生存、以规范促发展的逆转之路。2003年，与中国华源集团强强联合成立了安徽华源医药股份有限公司。2006年隶属国家大型央企——华润集团。
在上级党委政府、有关职能部门的正确领导和大力支持下，在社会各界的关心、关怀下，在公司全体员工的团结拼搏下，安徽华源医药已发展成为一个在全国各地拥有22个子公司、职工总数近万名、固定资产5亿多元的现代化大型企业，形成了“买全国药品，卖向全国”的经营格局，销售行情被誉为全国医药商业的“晴雨表”。2008年完成销售额121亿元，销售业绩连续10多年在全国医药商业企业中单体排名第一， 2008年、2009年公司连续两年位居中国医药商业百强企业第6位，2009年销售额将突破130亿元，先后荣获 “中国重点流通商业服务企业”、“改革开放30周年卓越贡献企业”等荣誉称号。
多年来，安徽华源医药销售定位始终以普药为主，网络覆盖中小城镇、广大农村，致力打造一个平民化、大众化的销售平台，以“品种全、价格低、质量好、服务优”四大优势享誉业界，以“规范救市、质量立市、诚信兴市、服务活市”四大抓手成为全国性的普药集散地之一。公司实行“五统一、一分销” 的经营管理模式（即：统一购进，统一仓储，统一财务，统一票据，统一价格，分公司销售），660多台电脑联网管理，牢牢把住购进、验收入库、储存养护、出库复核、对外销售等五个关口，构筑了严密的质量防火墙，保障了人民群众的用药安全，多年来没有出现过药品质量问题。公司拥有强大的库存能力，建有现代化仓库16万平方米，药品日常库存量价值16亿元，全年药品进出量约6000万件；全国4000多医药厂家的25000个品种在公司集散，来华源医药一家就可以配齐所需药品。公司拥有强大配调货能力，成立有专业的、现代化的华源物流公司，拥有700多台货运车辆，配送体系覆盖全国地级以上城市，药品运输安全快捷。
为进一步把医药产业做大做强，公司总投资5亿多元建设了华源医药物流园项目。项目规划占地600多亩，一期占地335亩，已投资2亿多元，总建筑面积15.8万平方米，包括华源物流办公区、6万平方米现代化的新药品仓库、1.8万平方米的保健品、中药饮片展销大厅、二期已建成六座现代化的营业大楼。三期工程建设一栋“H”型20层的综合写字楼和一座办公楼。
去年以来，两次在企业所在地安徽省太和县举办了全国性医药大会——华药会。2009华药会共有1200多家企业布展，100多位国家有关部委领导、权威专家学者，4000多家医药企业老总、上万名经销商、采购商莅临太和，展区人流量超过10万人次。
医药产业带动了太和金融、通讯、运输、宾馆、餐饮、房产等产业的繁荣，直接和间接解决了数万人员的就业。近几年，本着回报社会的原则，公司在慈善公益事业的投入累计达2000多万元。
今后一段时期，在上级党委政府的正确领导下，公司将认真实践科学发展观，以太和为大本营，以国家新医改为契机，以打造国内一流的大众化、平民化平台为目标，充分发挥医药商业优势，组建制药集团(已拥有上海华源安徽仁济制药、安徽锦辉制药、安徽广生药业、宁夏沙塞制药四家制药企业)，异地组建商业子公司（已在北京、宁夏银川、四川遂宁市设立商业子公司），全力打造会展平台（每年举办一届华药会）、保健品平台（已建成1.8万平方米的保健品展销大厅，218家保健品经营企业入驻，年保健品销售额20亿元以上）、物流平台（以药品运输为主、其它商品流通为补充，立足中原、面向全国）、原料药平台（全国性原料药集散地）、电子商务平台（拥有上万名会员，网上年交易额上亿元，已成为国内较大的医药门户网站和信息平台之一）等五大平台，使各项产业互补、互促，最终形成以医药商业为核心的医药产业链，3年内力争销售额完成200亿元，实现“商业上规模，工业求利润，现代物流为保障”的战略目标，进一步把企业做大做强，更好地促进地方经济的发展。
