类书与百科全书在古代被视作同类，但其本质和编纂方式有着显著的差异。首先，编纂方法上，类书侧重于收集原始资料，注重资料性，而百科全书则是对已有知识进行加工整理，反映了编纂者的个人知识水平。其次，编排方式不同，类书按资料类别排列，展示内部联系，百科全书则以条目字顺编排，通过索引体现内部联系。内容上，类书通常关注文史，百科全书涵盖更广泛的知识，自然科学是其重点。编纂后的维护也不同，类书鲜有后续修订，百科全书则定期更新以保持准确性。
此外，百科全书还配备了完善的索引体系和参考书目，类书则不具备这些功能。总的来说，类书与百科全书在工具书性质上有着根本区别。类书与丛书的区分在于，丛书是将单行书籍汇总成套，以便保存古籍，如《儒学警悟》和《百川学海》。丛书内的书籍独立存在，有特定的总名和编号，而类书则是根据材料选择和分类编排。
类书与丛书的共同点在于都源自众书，但类书是编纂而成，而丛书是集成已有的。中国古代的丛书如《四库全书》规模宏大，而现代的类书如《中国历代文献精粹大典》则是对历史文献的系统整理，如《中华大典》的规模更是超越以往。
总的来说，类书和丛书是古代文化的重要载体，反映了时代的知识积累和编纂智慧。现代虽然也沿用类书形式，但内容和编纂方法更加现代化和科学化。
古代的“数据库”-类书摘 要：本文从信息时代的视角，指出类书研究的误区，用全新的观念界定了类书的功能及本质属性；认为类书不是古人的专利，没有约定俗成的模式；相关文献数据库，甚至古今丛书等皆可视为类书样式或演变，揭示了文献的传承关系。