一、地理分布不同
1、汉藏语系：地理分布主要是亚洲。
2、印欧语系：地理分布主要是欧洲、亚洲、美洲、大洋洲。
二、类别不同
1、汉藏语系：中国学者一般认为这个语系至少包含汉语、藏缅语族、苗瑶语族以及壮侗语族，共计约四百种语言，但现代一些西方学者则否认苗瑶语族和壮侗语族属于汉藏语系，而把它们看作是各自单独的语系。
2、印欧语系：如今印欧语系包含了四百多种语言，其中包括印度-伊朗语族、日耳曼语族、罗曼语族、凯尔特语族、斯拉夫语族、希腊语族、波罗的语族、阿尔巴尼亚语和亚美尼亚语几大类。
三、特征不同
1、汉藏语系：由于汉藏语系语言的历史比较尚未全面、深入进行，因而对其特点的认识主要在现状方面。通过语言比较可以看出，不同语言间不仅在现状上有许多共同的特点，而且还存在着许多共同的发展规律。
2、印欧语系：印欧语系各语言原来都是屈折语，原始的印欧语的名词有3个性，3个数和8个格的变化（例如俄语这个特点保存得比较完好）；广泛利用词缀和词干元音音变来表达语法意义；名词和大部分形容词有格、性和数的变化；动词有时态、语态和语体的变化，主语和动词在变化中互相呼应。另外，印欧语系各语言的词都有重音。
参考资料来源：
一、分支不同
1、汉藏语系：分支主要为汉语、藏缅语族、壮侗语族等。
2、印欧语系：印度-伊朗语族、日耳曼语族、罗曼语族、凯尔特语族、斯拉夫语族、希腊语族、波罗的语族、阿尔巴尼亚语和亚美尼亚语几大类。
二、分布不同
1、汉藏语系：主要分布在中国、越南、老挝、柬埔寨、缅甸、泰国、印度、尼泊尔、不丹、孟加拉国、中亚（东干语）、东南亚等亚洲各地。
2、印欧语系：欧洲、亚洲、美洲、大洋洲。
三、语系特征不同
1、汉藏语系：每个音节有固定的声调是汉藏语系语言在语音上的重要特点；声调同声母、韵母的关系很密切，三者在发展过程中互相影响、互为条件。
2、印欧语系：印欧语系各语言原来都是屈折语，原始的印欧语的名词有3个性，3个数和8个格的变化（例如俄语这个特点保存得比较完好）；广泛利用词缀和词干元音音变来表达语法意义；名词和大部分形容词有格、性和数的变化；动词有时态、语态和语体的变化，主语和动词在变化中互相呼应。另外，印欧语系各语言的词都有重音。
本回答被网友采纳1、在语音方面，清浊音对应存在；
2、在词汇方面，拥有大量共同来源的词语，具有相似的语音形式和相似的结构形式；
3、在语法方面，具有曲折变化，要求数、性、格等保持形式上的一致。
汉藏语系语言在三个突出的共性特征：
1.除个别种类语言意外，每一个音节都以不同的声调表示不同的意义。2.单音节词根占绝大多数，而且大都可以自由运用。3.语序和虚词是表达语法意义的主要手段。