如果是在耕地上建设的厂房，与农户、村委会签订的租赁协议，由于耕地的性质是不能用于建造房屋的，厂房本身就是违法的，所以通常来说租赁人很难主张自己的补偿。但是租赁合同尚未到期已经支付房租的租赁人可以根据相关民事法律以及租赁合同向房东主张返还租金；
【拓展资料】
第一，农村土地分为农用地、建设用地、未利用地，这三种用途不能随便更改，如果在农用地上建房建厂，则属于违建；这是我国《土地管理法》明确规定的，如果村委会租给您的土地是不允许建厂的，则您可以根据《民法》里的合同相对性原则，让村委会进行赔偿，但违建的性质并不会因为有租赁合同且合同说明可以建厂而改变；
第二，同理，您办理了各种手续，合法经营，或者说缴纳了很多税等，都不会影响违法建筑的认定，这是两个不同的逻辑；
第三，您使用土地建厂，但是没有土地使用证、建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等，这直接导致了您是违法用地违法建设，至于村委会口头承诺办理证件，这个信息没有啥价值；
第四，如果被认定您的建筑属于违法建筑，则国家不予赔偿，因为《中华人民共和国赔偿法》只保护公民的合法权益，除非拆除过程中存在严重的违法行为，侵害了您其他的合法权益，会赔偿您此部分。
第五，如果拆迁部门拆迁过程中存在违法行为，您可以固定证据，向该部门申请国家赔偿，如果该部门不予赔偿，你可以向同级人民法院提起国家赔偿诉讼。
2、如果是合法厂房，与村委会通过村民大会签订的租赁合同，一般来说是可以获得相应的补偿的，补偿主要包括以下几部分：
（1）不可搬迁的大型机械、生产线等设施的补偿。这部分补偿对厂房来说应当是至关重要的，生产线及大型机械可以说是一个厂房的灵魂，而大部分机械都是难以搬迁或者搬迁后无法二次利用的，这部分的补偿通常占整体补偿的很大一部分，租赁人应当积极主张；
（2）搬迁费。厂房设施多，搬迁的难度大，补偿方通常会根据搬迁的难度及所需要的费用等确定一笔搬迁费的补偿，通常厂房的搬迁费也是一笔较大的补偿费用；
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