对16S rRNA可以进行哪些分析(包括方法)??

我已经得到16S rRNA基因序列,但是不知道如何分析! 望高人指点

蛋白质序列分析及结构预测:1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy(Compute pI/Mw)2.分析蛋白质的基本物理化学性质:ExPASy(ProtParam)3.分析蛋白质的亲水性和疏水性:ExPASy(ProtScale)4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物:ExPASy(PeptideMass) 5.分析蛋白质的信号肽:ExPASy(SignalP)6.预测蛋白质的二级结构:ExPASy(Jpred 3)多物种分子系统发育分析:EMBL(www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W
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第1个回答  2014-03-14
先在NCBI进行序列比对,搜索相似性高的序列,用诸如mega等软件建进化树,网上好多,搜索一下
第2个回答  2014-03-14
ExPASY工具从蛋白质序列出发,可以预测蛋白质的许多化学理化性质,包括理论等电点、相对分子质量、酶切特性、疏水性、电荷分布等。那疏水性来说,依据氨基酸分值越低亲水性越强,分值越高疏水性越强的规律。这个要通过你多看看生物信息学方面知识了,祝你好运