选择果蝇为实验材料。
过程及现象：选择红眼雌性和白眼雄性交配，后代（F1）无论雌雄都是红眼，再用F1杂交，后代（F2）中有四分之一为白眼且全部为雄性，其余四分之三为红眼，之中三分之一为雄性，三分之二为雌性。
分析：果蝇眼色的性状遗传符合分离定律，说明红眼、白眼受到一对等位基因控制，且红眼基因为显性。
由于白眼的遗传和性别有联系（所有的白眼必为雄性），摩尔根猜想，控制白眼的基因在X染色体上，而Y染色体不含它的等位基因，则上述现象可以解释。见下图。
是摩尔根第一个把一个特定的基因（控制眼色基因）和一条特定染色体（X染色体）联系起来，从而证明了基因在染色体上。
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