蛋白质序列如何用软件算出其分子量?

如题所述

把氨基酸的相对分子质量全部相加,然后减去n-1个水的质量就是了。

因为可以视为是n个氨基酸脱水缩合形成的n肽。

1. DNA序列包含的内切酶分析。在构建质粒的时候常常需要知道目的序列里面存在哪些内切酶位点,我们可以用Primer 5来分析。当然也可以用SMS在线工具分析。

输入序列,点击“Submit”,就会罗列出序列中所有的内切酶情况。

如果内切酶不存在,在Positions中显示“none”, 如果存在,则显示位置。

2. 计算DNA或者蛋白质序列的分子量。有时候我们知道一段DNA序列或者蛋白质序列,需要知道其相对分子量,当然有一个粗略的估计公式。在这里SMS提供了DNA和蛋白质序列相对分子量的计算。

3. 许多基因的启动子区域中存在一个富含GC的区域,称CpG岛。SMS在线工具提供了序列搜索CpG岛的方法。

点击提交之后,就会得到CpG岛的位置。

4.  序列化DNA或蛋白质序列。有时候我们复制一段序列的时候会带上一些其他标记,如 行号。用SMS在线工具能够直接去掉这些标记。

5. 蛋白质等电点。我们可以输入几段序列,分别得到该序列的等电点。

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