矩阵组织结构的主要优点如下：
1、提高决策效率：矩阵组织可以利用跨部门的团队和专家进行决策，利于综合考虑问题，作出更优的决策。
2、利用专业知识：矩阵组织可以充分利用公司的专业知识和技能，为解决复杂的跨职能问题提供强大的知识基础。
3、提高工作动机：矩阵组织为员工提供更广阔的事业发展空间，工作也更富有挑战性，这可以提高员工的工作动机和工作满意度。
4、加强沟通协调：矩阵组织需要不同部门和团队之间进行广泛的沟通与协作，这可以加强组织内部的联系，实现资源和信息的有效共享。
矩阵组织结构的主要缺点：
1、权责不清：矩阵组织的双重权责系统会导致权责不清，工作任务可能产生重复或遗漏，管理效率较低。
2、冲突增加：不同部门和项目团队之间容易产生矛盾和冲突，这会消耗较多的时间和精力进行协商和调解。
3、成本增加：矩阵组织需要投入较多资金用于沟通、协调和管理，会使组织运作成本显著增加。
4、工作压力大：员工需要同时完成部门主管和项目经理分配的工作任务，容易造成工作压力过大和工作过载的问题。
5、效率较低：矩阵组织的复杂工作环境和关系可能会降低组织运作的效率，特别是在决策和执行方面。
矩阵组织结构可以提高决策效率、利用专业知识、增加工作动机、加强沟通等。但也可能导致权责不清、冲突增加、成本上升、工作压力大和效率下降等问题。要发挥矩阵组织的优势，关键在于建立清晰的权责体系和有效的沟通机制。
矩阵组织结构具有以下重要意义
1、适应复杂环境：矩阵组织适用于组织环境较为复杂、业务范围较广、产品线较多的公司,能够灵活适应复杂变化的环境。
2、利用专业知识：矩阵组织可以充分利用组织内部的各类专业知识与技能,有利于解决复杂的跨部门或跨领域问题。
3、满足多重需求：矩阵组织可以同时兼顾功能部门和项目团队的需求,符合多重角色的工作要求,满足员工的不同需求。
4、提高工作动机：在矩阵组织中,员工可以同时从部门主管和项目经理获得工作认可与支持,这可以使其工作更富有挑战性与意义,工作动机和满意度较高。
5、促进协作关系：矩阵组织有利于形成部门之间以及部门与项目团队之间广泛而密切的合作关系,可以实现信息与资源的高效共享,达到合作共赢。