我某公司以CIF[术语]出口一批化肥,装运前按合同规定向保险公司投保,货物装货后顺利开航。载货船起航后不久就遭遇暴风雨,海水灌入舱内,部分化肥被水淹,损失1000美金,数日后没有发现部分化肥袋破裂,估计损失1500美元,问:该损失由谁承担?为什么?