我有一个细菌测序结果可是不会比对,有哪位前辈可以指教一下?

如题所述

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第1个回答 2014-03-14

网页上输入NCBI BLAST进入主页后黏贴你的序列，选择blastn表示核酸比对，blastx表示氨基酸比对，确定就有比对结果了

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细菌鉴定测序结果无法建树怎么办答：1，用“BioLign”打开后缀为AB1格式的测序结果文件，然后拖动鼠标选中所有碱基，Ctrl+C复制（用此软件打开测序文件后，会看到很多AGCT等很多碱基，同时也会有对应的4中颜色的“峰”，要看测序结果好不好就可以从这里知道了：除开测序的“头”和“尾”不看，就看中间的区域，看是不是单峰，如果有很多...

...有么有高手指点一下,本人不是这个专业的不懂啊 qq396821413_百度知 ...答：你不是全基因组测序吧，一般做分子鉴定的，都是部分序列才对。对于细菌啊放线菌啊等原核生物，一般测的都是16S rDNA，对于真菌一般18S和ITS的都有。一般你拿到序列后去NCBI上blast同源序列，然后用这些序列下载下来用Clustal X进行序列比对分析，然后把分析结果改成fas格式，最后用mega做出进化树一般就可...

测序时目的片段长度怎么写,要对一个细菌做鉴定,看它是不是细菌性穿孔...答：做细菌鉴定，可以采用最常的16s rRNA的通用引物，例如27F/1492R等进行PCR扩增，扩增所得1500BP左右的片段进行测序，测序结果再与数据库中的序列进行比对确认，是否是细菌性引起的问题。

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