33问答网
所有问题
当前搜索:
测序结果与已知序列比对
基因
测序结果与
应有
序列
比较是否一致,可以用什么软件来检测?
答:
这个直接到NCBI网页上,有个服务叫做BLAST,把测序得到的
序列
贴上去就可以了。http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 可以对2个序列进行
比对
,也可以和数据库中现有物种的
序列比对
。蛋白质氨基酸序列比对等等,很多功能,是目前功能最强大的序列比对系统。
怎样分析
测序结果
答:
1.假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你
测序
得到的基因
序列与已知
的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方.
比对
的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行.2.如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的
结果
进行比对,...
如何
比对
基因组
测序
数据?
答:
1、网络搜索下载并安装BioEdit软件。2、将你所要
比对
的
序列
以fasta格式粘贴在文本文档里。3、BioEdit软件打开文本文档,选中所有的序列,按下图方法选择要打开的标签。4、在新的窗口中,按下图所示勾选Note下面的方框(勾选之后可以在比对的
结果
中用星星表示,方便你看出哪些地方不一致)和运行“RunClustalW...
...对PCR扩增产物
测序
,
结果与
原
序列比对
同源性为60%,说明
答:
1.先看下PCR电泳图里杂带多不多,若有的话很可能非特异性扩增了 2.若条带干净,仍然有可能存在非特异性扩增,引物特异性不高导致竞争结合 可将DNA直接酶切看是否能切出你的目标片段 3.
序列比对结果
不能只看相似度,手工找一下看相同的序列出现在哪里怎么分布的,重复序列相似度高的话可能是零散的...
菌液
测序结果
怎么
比对
知道是正确的
答:
测序都是从5"端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向
测序结果
经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的
序列
文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。1.寻找引物
比对
,去除引物序列,找到目的片段。在DNAMan上进行比对,看引物...
基因组
序列比对
算法介绍(一)
答:
重
测序
基因组数据
比对
,是指将测序仪下机fastq数据(NGS read
序列
,通常100-150bp),与人类参考基因组(reference)进行匹配,允许错配(mismatch),插入缺失(indel),目的是在参考基因组找到序列最相似的位置,通常是基因组分析(包括 variation calling,ChIP-seq,RNA-seq,BS-seq)流程的第一步。常...
16SrDNA
测序
后在ncbi上
比对
答:
你可以打开NCBI
序列
的详细信息,里面有标示是否unpublished,标有unpublished就说明是没有被认可的,这种对比
结果
你是不能采用的,因为对比的对象都是不可信的。比如我今天做了一个菌,发现和大肠杆菌的最相似,相似度是97%,然后我上传了这个序列,名称当然只能写大肠杆菌,但是到底是不是还有待鉴定,然后...
关于
已知
DNA
序列
在NCBI上
比对
并鉴定菌种
答:
3. 用这条
序列
做blast。下面是物种报告。可以肯定的是你的细菌来自Firmicutes门。其他的就不能肯定了,应为所有的匹配序列都是100%匹配你的最佳测序区段。个人感觉你的
测序结果
还有很大的提升空间,应该在实验上在下下功夫。Taxonomy Report Bacteria ... 100 hits 4 orgs [root; cellular organ...
我有一个
测序
的
结果
,可是我不会进行
比对
,能详细的告诉我一下步骤吗...
答:
如果是人或老鼠的话,就可以直接选择了如果是其他物种就要选择“others”了,这时候网页会主动跳出一个下拉对话框和一个输入式对话框,你可以分别选择和输入要跟你的
序列比对
的序列种类和物种。下面的 Entrez Query 可以对
比对结果
进行适当的限制。 Program Selection 部分其实是让我们选择本次比对的精确度...
16SrDNA
测序结果
并基因
比对
后所得结果怎样得该菌的属种?
答:
有专门的16srRNA数据库,里面每个
序列
对应什么菌种有注释,你将你的序列与其中的序列进行
比对
,找到最相似的那条序列,就可以认为你的菌种就是那条序列所代表的菌种
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜
测序结果怎么比对
snapgene测序结果序列比对
测序后怎么比对序列
CDS序列不能用于比对测序吗
怎么比对峰图的基因序列
snapgene怎么比对测序结果
基因组测序深度计算公式
抗体可变区测序怎么比对序列
CDS和DNA序列比对