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测序结果与已知序列比对
...1与ITS4基因,送去测序,现在
测序结果
出来了,该怎样
比对
,
答:
不好意思,不太用这个账号了,没看到。应该已经解决了吧。请使用NCBI BLASTn.将
序列
输入,在基因组选项勾选other即可,默认的对照基因组是人类和小鼠。
如何根据基因
测序
分析
结果
找通路
答:
研究
结果
:1、亚洲棉三代基因组组装:利用三代
测序和
Hi-C相结合的方法进行亚洲棉基因组组装。共计获得了142.54 Gb ,组装1.71 Gb亚洲棉基因组,Contig N50=1.1 Mb,最长的Contig为12.37 Mb。利用Hi-C技术将组装的1573 Mb的数据定位到13条染色体上,与已经发表的基因组相比,当Hi-C数据
比对
到...
如何鉴定一个
已知
rdna-its
序列
的菌种
答:
利用ITS序列分析可以实现对多数品种真菌的快速准确鉴定。鉴定中无需反复培养进行生理生化反应和实验,极大缩短了鉴定周期和鉴定准确度。鉴定步骤包括:* 提取微生物样品DNA* 扩增出真菌ITS区序列* DNA
测序
,将样品序列与GenBank中
已知序列
进行
比对
* 判定微生物种类,可将微生物划分到属或种* 与同源性较高...
怎样分析
测序结果
答:
用Chromas等软件打开
测序结果
,查看峰图质量
和序列
是否正确。
比对序列
的话我个人更习惯用seqman软件
克隆某个基因的cds
序列
,大小对,但
测序
不对怎么回事
答:
克隆出来基因
序列
并
测序
之后,通常先要鉴定这个序列是不是符合我们要求的,通常用生物信息学的方法,去ncbi做一个blastx,通过
比对结果
来判断这个序列是什么基因,此外,blastx结果会给出比对的方向,很容易就可以判定你测序的那条序列是正向的还是反向的,如果是反向的,那么就需要把它进行互补翻转,就得到了编码...
三份猴痘病毒最新基因
测序结果
公布,其中哪些信息值得关注?
答:
来自葡萄牙、比利时、美国的三个研究小组分别公布在全球多地暴发的猴痘(Monkeypox)疫情中感染者所携带病毒基因组
序列
的初步结果。猴痘病毒最新基因
测序结果
公布,哪些信息值得关注感染猴痘的人通常在感染后7到14天开始出现症状,病情通常会持续几个星期。世界卫生组织和美国疾病控制与预防中心都宣称,“尽管大...
菌液
测序结果
分析求助
答:
测序都是从5"端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向
测序结果
经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的
序列
文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。1.寻找引物
比对
,去除引物序列,找到目的片段。在DNAMan上进行比对,看引物...
测序完成后怎样检测
测序结果
的准确性
答:
1、看
测序
质量:Q20、N多不多。2、GC含量是否分离,与基因组相比较是不是差距较大。3、如果有基因组的话,和基因组
比对
一下,看比对效率高不高。4、如果测序测的深度够深的话,一般不用检查,单条
序列
的准确性低对后续分析影响不大。
第二代DNA
测序
技术的操作流程
答:
但是只有通过这一步前面的工作才显得有意义。
测序
得到的原始数据是长度只有几十个碱基的序列,要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架,或者把这些
序列比对
到已有的基因组或者相近物种基因组序列上,并进一步分析得到有生物学意义的
结果
。
我有一个细菌
测序结果
可是不会
比对
,有哪位前辈可以指教一下?_百度知 ...
答:
网页上输入NCBI BLAST进入主页后黏贴你的
序列
,选择blastn表示核酸比对,blastx表示氨基酸比对,确定就有
比对结果
了
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