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测序结果与已知序列比对
测序结果比对
的软件图ab1怎么用
答:
你可以发给我,我可以帮你修改;但是有一点你必须明白:.ab1文件是
测序
仪出的报告文件,里面的内容只有峰位置信息及样品信息还有一些仪器运行参数。
序列
信息是根据峰位置,通过软件做出的修正
结果
。峰图是因,序列是果。我用DNAMAN给你演示一下吧首先依次点击file-openspecial-AB1/SCFtrace打开扩展名为.ab1...
16S rRNA怎样进行
序列
分析
比对
答:
百度EZTaxon,进去之后注册,登录,左边Identify Step 1 在空白处按照如下格式输入 >
序列
名称(自己写,能认识就行)序列(
测序结果
,只含ATCG)如:>E.coli ATCGATCG...Step 2显示的是最相近种的数量 Step 3默认就行了
比对
完之后在左边的Result里看结果 ...
基因
序列
比较怎么分析
答:
基因序列比较怎么分析
测序
得到基因序列后一般都需要进行
序列比对
,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。不用担心,多熟悉几遍就可以操作了,很简单的,要对自己有信心,加油!
如何对基因
测序结果
进行分析
答:
测序
得到基因序列后一般都需要进行
序列比对
,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。克隆至质粒载体中后集中测序〔9,10〕。sAGE的最终
结果
是通过计算机统计得到的,根据某个标签出现频率的高低来...
16SrDNA
测序结果
并基因
比对
后所得结果怎样得该菌的属种?
答:
有专门的16srRNA数据库,里面每个
序列
对应什么菌种有注释,你将你的序列与其中的序列进行
比对
,找到最相似的那条序列,就可以认为你的菌种就是那条序列所代表的菌种
如何确定
测序
回来的
序列
就是我要的目的序列?
答:
进行
序列比对
。可以在ncbi中进行blast比对,也可以用一些软件,如DNAMAN等。blast比对网址:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on&LINK_LOC=blasthome 有一些细节说不清的。还是需要有人在旁边教,很简单,看一次...
我有一个
测序
的
结果
,可是我不会进行
比对
,能详细的告诉我一下步骤吗...
答:
如果是人或老鼠的话,就可以直接选择了如果是其他物种就要选择“others”了,这时候网页会主动跳出一个下拉对话框和一个输入式对话框,你可以分别选择和输入要跟你的
序列比对
的序列种类和物种。下面的 Entrez Query 可以对
比对结果
进行适当的限制。 Program Selection 部分其实是让我们选择本次比对的精确度...
根据基因
测序结果
如何区分基因型
答:
将你的
测序结果与
参考
序列
进行
比对
,当然前提你是知道你的参考序列的突变位置,如果你的参考序列上是A,而测出来的结果是T,那就是一个突变型,还有可能就是杂合突变。
我
测序
了两条植物类病毒
序列
(RNA),但是不知如何在NCBI里
比对
?
答:
去NCBI首页,选择Blast,然后一般用blastn方法比较
16srDNA 测出的两条
序列
都要
比对
吗?要拼接吗? 请高手指导一下,详细最好...
答:
那可以直接做拼接。另外,最好把测序长度超过800bp的序列也剔除掉,因为在一个测序反应里超过800bp的
序列测序
准确率低,可以参照测序峰图剔除测序差的序列。载体
序列和测序
差的序列都会影响到拼接。软件的使用比较简单,把你的序列文件做成fasta格式输入就可以。最后拼接得到的consensus序列可以输出到文本。
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