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当前搜索:
ncbi序列比对看的是什么
ncbi
blast
序列比对
结果怎么看序列比对结果怎么看
答:
1、到
NCBI
用BLAST,很简单的。2、把你的
序列
贴上去,选物种,然后就可以了。本文到此分享完毕,希望对大家有所帮助。
如何看懂
NCBI
BLAST输出结果
答:
掌握了下面这几个概念,你就理解
NCBI
BLAST输出结果了。alignments 代表比对上的两个序列 hits 表示两个
序列比对
上的片段 Score 比对得分,如果序列匹配上得分,不一样,减分,分值越高,两个序列相似性越高 E Value 值越小,越可信,相对的一个统计值。Length 输入序列的长度 Identities 一致性,就是...
本地blast
序列比对
结果怎么看
答:
BLAST 的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLAST Assembled Genomes、Basic BLAST、Specialized BLAST。相信大家可以看懂这三个短语的意思,我就不多说了;我要说 的是,可以认为这是三种
序列比对
的方法,或者说是BLAST 的三条途径。第一部分BLAST Assembled Genomes 就是让你选择你要比对的物种,点击...
如何用
ncbi
查找
比对
基因
序列
答:
GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性.对于每一条递交给
NCBI的序列
,都会付给一个编号,而 且这个编号对应的序列不可更改.这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与我们用的身份证号.因此,利用GI
在NCBI
中查询时,你只要把数据库(蛋白质/ 核苷酸)选对,只要输入这个...
ncbi
常用的
序列
搜索
比对
工具是
答:
NCBI常用的序列搜索比对工具是BLAST
。BLAST是NCBI中常用的序列搜索比对工具,用于在DNA、蛋白质等生物信息学领域进行序列比对和相似性搜索。BLAST通过算法对输入的序列进行比对,在数据库中找到相似的序列。该工具广泛应用于基因功能研究、物种鉴定、蛋白质相互作用等领域。以下是关于BLAST的详细介绍:BLAST作为...
关于种属鉴定、
NCBI的
BLAST
比对
和DNAMAN同源性分析的问题
答:
ncbi
主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将
序列
粘入窗口中 选择nucleotide cllection(nr/nt)选项 进行
比对
就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列
16SrDNA测序后
在ncbi上比对
答:
然后明天你也做了同一种菌,然后对比,发现和我的相似度是99%,那你说你做的菌也大肠杆菌?显然是没有道理的。你可以用
NCBI比对
,但是你必须要
看序列是
不是unpublished的 所以有韩国人为了方便就自己建立了一个二级数据库,剔除了NCBI中unpublished的序列,你搜索Eztaxon就能搜到。
NCBI
进行BLAST检索时Query coverage的同源百分比和Max ident的百分比...
答:
Query coverage表示的是所
比对序列
与目标序列的覆盖度 identity表示的是所比对序列与目标序列的相似度。不同的衡量标准,如果是看进化地位,建议建树后比较同源性。
测序出来的
序列
,
在NCBI
网站上
比对
相似度,寻找相似度100%或99%
的是
为 ...
答:
找到你测的
序列是什么
物种,如果是100%,说明你测的这个物种就是你
在NCBI上
找到的这个。
关于DNA
序列在NCBI上比对
的问题
答:
得到
比对的
结果里头如果有完全配对的,看看这些完全配对的序列出自
什么
菌种(不能有两个菌种的序列和你的序列相同,如果相同,那么就不能作为鉴定菌种的特征序列了),并且查阅提交这个
序列的
相关文献。得到进一步的信息。我说的步骤,只要你认真
看NCBI的
网页,你自己应该是可以操作下去的。
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