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测序出来的序列比对不上
blast
比对
结果不一致说明什么
答:
你在用DNAMAN的多
序列比对
时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你
测序
得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交
的序列
都是编码链的序列。
菌液
测序
结果怎么
比对
知道是正确的
答:
在DNAMan上进行
比对
,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比
不上
,那可能就不是你要
的序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。批注:PCR产物进行
测序
的结果可能不包含引物...
ncbi中blast
比对
,sbjct和标准不一致,为什么
答:
你在用DNAMAN的多
序列比对
时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你
测序
得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交
的序列
都是编码链的序列。
测序
结果怎么分析
答:
在DNAMan上进行
比对
,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比
不上
,那可能就不是你要
的序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。批注:PCR产物进行
测序
的结果可能不包含引物...
菌液
测序
结果分析求助
答:
在DNAMan上进行
比对
,看引物能不能比对上(一个不变,一个反向互补),如果比
不上
,那可能就不是你要
的序列
,如果能比上,上游以引物第一个为分界线,去除前面的;下有一最后一个为分界线,去除后面的,剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。批注:PCR产物进行
测序
的结果可能不包含引物...
怎样分析基因
测序
结果
答:
答:一、基因
测序的
结果的内涵 基因测序的结果是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全
序列
,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。二、基因测序的作用 锁定个人病变基因,提前预防和治疗。
二代
测序
结果如何分析
答:
二代
测序
结果分析方法如下:1、首先,对二代测序数据进行预处理,去除低质量
的序列
,去除序列中的重复部分。2、其次,进行
序列比对
和变异检测,确定每个序列在基因组上的位置是否正常。3、最后,对比数据和检测结果,得出最终分析报告。
怎么进行核酸
序列比对
?
答:
容易了,我每天都在做这个 上NCBI的blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/BlastGen/BlastGen.cgi?taxid=4530 把你
的序列
拷贝过去,Database:这个选Refseq RNA,其它参数默认..你肯定没有选择数据库,是在水稻的全基因组里搜索了,因为NC_008397是chromosome 4的全长序列..不懂你再call我.....
测序
结果如何知道是不是自己想要的目的片段,如何比较!
答:
对于
测序
结果您首先应核对的载体是否正确,其次是您克隆之前PCR特异性引物是否能找到,如果这两个条件满足的话,就可以确认是您的东西了。至于插入片段是否与您预期的一致,那么可以在NCBI中将测序结果与您的目的
序列
进行BLAST
比对
,看匹配度;也可以在一些比对软件中,例如“DNASTAR”等中进行拼接比对。
基因
序列
比较怎么分析
答:
基因序列比较怎么分析
测序
得到基因序列后一般都需要进行
序列比对
,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对,推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。不用担心,多熟悉几遍就可以操作了,很简单的,要对自己有信心,加油!
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