小白求助帖，关于dnastar的使用和突变位点的寻找

Question

小白求助帖，关于dnastar的使用和突变位点的寻找
浏览次数：2次悬赏分：0 | 离问题结束还有 14 天 23 小时 | 提问者：匿名
问题补充：
本人是本科生，对于很多东西都不是很懂，要是问了一些很幼稚的问题希望各位不要鄙视哦!
1.PCR产物拿去生物公司测序后发回来的文件名字看不懂，比如：
B*********69.**.F()_A01.ab1
B*********69.**.F()_A01.seq
B*********69.**.F()_E03.ab1
B*********69.**.F()_E03.seq
B*********70.**.R()_E04.ab1
B*********70.**.R()_E04.seq
这种名字都代表的是什么意思？尤其是F和R，因为我做的是双向测序，F和R是不是上下游的意思？双向测序是不是还要用程序做序列拼接？

2.我要用这些序列寻找突变位点，用什么程序？DNASTAR可以不？然后求教具体操作过程。

以上，暂时就这些了，如果还有问题我还会再来求助的，先谢谢各位的应助了！

Answer 1

F表示是用正向引物测出来的序列，R表示使用反向测出来的。
seq是文件格式，一般序列分析软件都可以读的。ab1的文件可以看测序的峰图，一般是需要具体分析测序结果是才会用的。
DNASTAR是可以分析的，你先找到参考序列，然后拿测序结果和参考序列去比对，就可以看到突变位点了。追问

嗯嗯，我这几天刚看了一些资料，知道怎么比对了，但是那个测序结果要不要序列拼接啊？因为测序结果里面还有TXT文件，我在想是不是已经拼接好了的……

追答

如果是拼接好的应该会有说明的。我一般是不拼接的，直接先用F测出来的序列去和参考序列比较，前800bp的结果是可信的。然后再把R测出来的序列反向互补一下，再比较一下，还是信800bp内的结果。这样，就大概有1500左右的序列是可信的了。

追问

恩恩，我也发现测序到800bp那样子就不准确了。谢谢额，对我帮助很大！

追答

好吧，把最佳答案给我吧，呵呵。